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晶蛋生物计算机虚拟筛选和分子对接平台

Time:2021-03-16Author:

      新药研发是制药行业最为复杂和最富挑战性的一个环节,一个药物的成败是其活性,生物可利用度和毒性等等诸多因素综合作用的结果。计算机辅助药物设计(Computer Aided Drug Design,CADD)是依据结构生物学、生物化学、酶学、分子生物学以及遗传学等生命科学的研究成果,针对这些基础研究中所揭示的包括酶、受体、离子通道及核酸等潜在的药物设计靶点,并参考其它类源性配体或天然产物的化学结构特征,以计算机化学为基础,通过计算机的模拟、计算和预算药物与受体生物大分子之间的相互作用,考察药物与靶点的结构互补、性质互补等,设计出合理的药物分子。

      对于一个药物学家来说,最赏心悦目的画面莫过于蛋白的三维结构和小分子的复合晶体结构。基于结构的药物发现最具逻辑性,也最有成就感。晶体生物基于自身的计算机虚拟筛选和分子对接平台(如下图),已经成功解析了数百种药物靶点结构,其中包括数十个离子通道蛋白、GPCR和PARPs家族的结构解析。公司成立至今已经解析储备了超过20个靶点结构。


分子对接成功案例

      在 “PARPs肿瘤新药临床前研究”方面,晶蛋生物现已获得数十个PARPs与不同小分子化合物的复合物晶体结构,采用基于结构的药物筛选和分子对接的方法发现并设计了一大批高活性的新型小分子抑制剂(如下图)。

      我们基于自己的化合物数据库和商业化的ChemDiv, TargetMol, Enamine, ChemBridge等化合物数据库中共200多万小分子,其中大部分都是可以购买到的实体化合物。采用Dock, Discovery Studio, Schrodinger等软件进行蛋白结构模建、分子动力学模拟、 量子化学计算等分子模拟计算。选取得分高的100个左右化合物,在体外进行分子和细胞水平的测试,最终得到了10个亲和力在μM级别的化合物。通过针对Parps的虚拟筛选,我们从百万级别的化合物中,迅速筛选到了μM级别的化合物,提高了新药研发的速度,缩短了药物研发的周期,节省人力成本和时间成本。


欢迎有科研合作需求的企业和科研机构等联系我们(刘小姐 13570687960微信同号),或关注我们的官方网站(http://www.crystalobio.com/)获取更多关于我们公司项目、产品和服务的信息。